Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYT12Q8IV01 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYT12Q8IV01 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYT12Q8IV01 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYT12Q8IV01 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYT12Q8IV01 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYT12Q8IV01 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT12Q8IV01 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT12Q8IV01 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYT12Q8IV01 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYT12Q8IV01 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYT12Q8IV01 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYT12Q8IV01 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SYT12Q8IV01 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYT12Q8IV01 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYT12Q8IV01 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SYT12Q8IV01 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYT12Q8IV01 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYT12Q8IV01 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SYT12Q8IV01 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYT12Q8IV01 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYT12Q8IV01 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYT12Q8IV01 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYT12Q8IV01 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYT12Q8IV01 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYT12Q8IV01 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYT12Q8IV01 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT12Q8IV01 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT12Q8IV01 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT12Q8IV01 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT12Q8IV01 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT12Q8IV01 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT12Q8IV01 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT12Q8IV01 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT12Q8IV01 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT12Q8IV01 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT12Q8IV01 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT12Q8IV01 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT12Q8IV01 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT12Q8IV01 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT12Q8IV01 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT12Q8IV01 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT12Q8IV01 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT12Q8IV01 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT12Q8IV01 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT12Q8IV01 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT12Q8IV01 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT12Q8IV01 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT12Q8IV01 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms