Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z419

RNF144B, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144B, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF144BQ7Z419 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF144BQ7Z419 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF144BQ7Z419 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RNF144BQ7Z419 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RNF144BQ7Z419 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
RNF144BQ7Z419 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF144BQ7Z419 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF144BQ7Z419 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF144BQ7Z419 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF144BQ7Z419 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF144BQ7Z419 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF144BQ7Z419 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF144BQ7Z419 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF144BQ7Z419 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF144BQ7Z419 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF144BQ7Z419 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF144BQ7Z419 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF144BQ7Z419 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF144BQ7Z419 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF144BQ7Z419 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF144BQ7Z419 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF144BQ7Z419 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF144BQ7Z419 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF144BQ7Z419 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF144BQ7Z419 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF144BQ7Z419 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF144BQ7Z419 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF144BQ7Z419 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF144BQ7Z419 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF144BQ7Z419 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF144BQ7Z419 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF144BQ7Z419 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF144BQ7Z419 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF144BQ7Z419 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms