Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMC6Q7Z403 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMC6Q7Z403 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMC6Q7Z403 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMC6Q7Z403 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TMC6Q7Z403 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMC6Q7Z403 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMC6Q7Z403 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMC6Q7Z403 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMC6Q7Z403 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMC6Q7Z403 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMC6Q7Z403 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMC6Q7Z403 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMC6Q7Z403 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMC6Q7Z403 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMC6Q7Z403 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMC6Q7Z403 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMC6Q7Z403 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMC6Q7Z403 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMC6Q7Z403 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMC6Q7Z403 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMC6Q7Z403 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMC6Q7Z403 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TMC6Q7Z403 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMC6Q7Z403 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMC6Q7Z403 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMC6Q7Z403 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMC6Q7Z403 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMC6Q7Z403 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMC6Q7Z403 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMC6Q7Z403 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMC6Q7Z403 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMC6Q7Z403 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMC6Q7Z403 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMC6Q7Z403 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMC6Q7Z403 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMC6Q7Z403 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMC6Q7Z403 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TMC6Q7Z403 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMC6Q7Z403 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMC6Q7Z403 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms