Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTF1AQ7RTS3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTF1AQ7RTS3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTF1AQ7RTS3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTF1AQ7RTS3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTF1AQ7RTS3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTF1AQ7RTS3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTF1AQ7RTS3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTF1AQ7RTS3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTF1AQ7RTS3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTF1AQ7RTS3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTF1AQ7RTS3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PTF1AQ7RTS3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTF1AQ7RTS3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTF1AQ7RTS3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTF1AQ7RTS3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTF1AQ7RTS3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
PTF1AQ7RTS3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTF1AQ7RTS3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTF1AQ7RTS3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTF1AQ7RTS3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTF1AQ7RTS3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTF1AQ7RTS3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTF1AQ7RTS3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTF1AQ7RTS3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTF1AQ7RTS3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTF1AQ7RTS3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTF1AQ7RTS3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTF1AQ7RTS3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTF1AQ7RTS3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTF1AQ7RTS3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTF1AQ7RTS3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTF1AQ7RTS3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTF1AQ7RTS3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTF1AQ7RTS3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTF1AQ7RTS3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTF1AQ7RTS3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTF1AQ7RTS3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTF1AQ7RTS3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTF1AQ7RTS3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTF1AQ7RTS3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTF1AQ7RTS3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTF1AQ7RTS3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTF1AQ7RTS3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTF1AQ7RTS3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTF1AQ7RTS3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTF1AQ7RTS3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PTF1AQ7RTS3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTF1AQ7RTS3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PTF1AQ7RTS3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PTF1AQ7RTS3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PTF1AQ7RTS3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTF1AQ7RTS3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTF1AQ7RTS3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTF1AQ7RTS3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
PTF1AQ7RTS3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PTF1AQ7RTS3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTF1AQ7RTS3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTF1AQ7RTS3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PTF1AQ7RTS3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTF1AQ7RTS3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTF1AQ7RTS3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTF1AQ7RTS3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTF1AQ7RTS3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTF1AQ7RTS3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTF1AQ7RTS3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTF1AQ7RTS3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTF1AQ7RTS3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTF1AQ7RTS3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTF1AQ7RTS3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTF1AQ7RTS3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTF1AQ7RTS3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTF1AQ7RTS3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PTF1AQ7RTS3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PTF1AQ7RTS3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTF1AQ7RTS3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTF1AQ7RTS3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTF1AQ7RTS3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTF1AQ7RTS3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms