Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL17Q6TDP4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KLHL17Q6TDP4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL17Q6TDP4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHL17Q6TDP4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL17Q6TDP4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL17Q6TDP4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL17Q6TDP4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHL17Q6TDP4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL17Q6TDP4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHL17Q6TDP4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL17Q6TDP4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL17Q6TDP4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL17Q6TDP4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL17Q6TDP4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL17Q6TDP4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL17Q6TDP4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL17Q6TDP4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL17Q6TDP4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL17Q6TDP4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL17Q6TDP4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL17Q6TDP4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL17Q6TDP4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL17Q6TDP4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL17Q6TDP4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL17Q6TDP4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL17Q6TDP4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL17Q6TDP4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL17Q6TDP4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL17Q6TDP4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL17Q6TDP4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL17Q6TDP4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL17Q6TDP4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL17Q6TDP4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHL17Q6TDP4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL17Q6TDP4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms