Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A4Q6P1M0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A4Q6P1M0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A4Q6P1M0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A4Q6P1M0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A4Q6P1M0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A4Q6P1M0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A4Q6P1M0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A4Q6P1M0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A4Q6P1M0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A4Q6P1M0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC27A4Q6P1M0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC27A4Q6P1M0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A4Q6P1M0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A4Q6P1M0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A4Q6P1M0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC27A4Q6P1M0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC27A4Q6P1M0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC27A4Q6P1M0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC27A4Q6P1M0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A4Q6P1M0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A4Q6P1M0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC27A4Q6P1M0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC27A4Q6P1M0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A4Q6P1M0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC27A4Q6P1M0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A4Q6P1M0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A4Q6P1M0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC27A4Q6P1M0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC27A4Q6P1M0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A4Q6P1M0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A4Q6P1M0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC27A4Q6P1M0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A4Q6P1M0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC27A4Q6P1M0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A4Q6P1M0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC27A4Q6P1M0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A4Q6P1M0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC27A4Q6P1M0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A4Q6P1M0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A4Q6P1M0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A4Q6P1M0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC27A4Q6P1M0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A4Q6P1M0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A4Q6P1M0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC27A4Q6P1M0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A4Q6P1M0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC27A4Q6P1M0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A4Q6P1M0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC27A4Q6P1M0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A4Q6P1M0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A4Q6P1M0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A4Q6P1M0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A4Q6P1M0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A4Q6P1M0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A4Q6P1M0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A4Q6P1M0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A4Q6P1M0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A4Q6P1M0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms