Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCM7

SLC25A25, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A25Q6KCM7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC25A25Q6KCM7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A25Q6KCM7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A25Q6KCM7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC25A25Q6KCM7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC25A25Q6KCM7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC25A25Q6KCM7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC25A25Q6KCM7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC25A25Q6KCM7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A25Q6KCM7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC25A25Q6KCM7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC25A25Q6KCM7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC25A25Q6KCM7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC25A25Q6KCM7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC25A25Q6KCM7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC25A25Q6KCM7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC25A25Q6KCM7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC25A25Q6KCM7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC25A25Q6KCM7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC25A25Q6KCM7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC25A25Q6KCM7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC25A25Q6KCM7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A25Q6KCM7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A25Q6KCM7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A25Q6KCM7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A25Q6KCM7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A25Q6KCM7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A25Q6KCM7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A25Q6KCM7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SLC25A25Q6KCM7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A25Q6KCM7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A25Q6KCM7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A25Q6KCM7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A25Q6KCM7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A25Q6KCM7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A25Q6KCM7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A25Q6KCM7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A25Q6KCM7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A25Q6KCM7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC25A25Q6KCM7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC25A25Q6KCM7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms