Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMBRD2Q68DH5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMBRD2Q68DH5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMBRD2Q68DH5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMBRD2Q68DH5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMBRD2Q68DH5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMBRD2Q68DH5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LMBRD2Q68DH5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMBRD2Q68DH5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMBRD2Q68DH5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMBRD2Q68DH5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMBRD2Q68DH5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LMBRD2Q68DH5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMBRD2Q68DH5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMBRD2Q68DH5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMBRD2Q68DH5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBRD2Q68DH5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBRD2Q68DH5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMBRD2Q68DH5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMBRD2Q68DH5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LMBRD2Q68DH5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBRD2Q68DH5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
LMBRD2Q68DH5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMBRD2Q68DH5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBRD2Q68DH5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBRD2Q68DH5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMBRD2Q68DH5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMBRD2Q68DH5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMBRD2Q68DH5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMBRD2Q68DH5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMBRD2Q68DH5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LMBRD2Q68DH5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LMBRD2Q68DH5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBRD2Q68DH5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBRD2Q68DH5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBRD2Q68DH5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBRD2Q68DH5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBRD2Q68DH5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMBRD2Q68DH5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMBRD2Q68DH5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMBRD2Q68DH5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMBRD2Q68DH5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBRD2Q68DH5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBRD2Q68DH5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBRD2Q68DH5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBRD2Q68DH5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBRD2Q68DH5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBRD2Q68DH5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBRD2Q68DH5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBRD2Q68DH5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBRD2Q68DH5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBRD2Q68DH5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LMBRD2Q68DH5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBRD2Q68DH5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LMBRD2Q68DH5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LMBRD2Q68DH5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMBRD2Q68DH5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMBRD2Q68DH5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMBRD2Q68DH5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LMBRD2Q68DH5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMBRD2Q68DH5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms