Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYY2

LIPM, Lipase member M, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPMQ5VYY2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIPMQ5VYY2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIPMQ5VYY2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIPMQ5VYY2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIPMQ5VYY2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIPMQ5VYY2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIPMQ5VYY2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIPMQ5VYY2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIPMQ5VYY2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIPMQ5VYY2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LIPMQ5VYY2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIPMQ5VYY2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIPMQ5VYY2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIPMQ5VYY2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LIPMQ5VYY2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIPMQ5VYY2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIPMQ5VYY2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIPMQ5VYY2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIPMQ5VYY2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIPMQ5VYY2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIPMQ5VYY2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIPMQ5VYY2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIPMQ5VYY2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LIPMQ5VYY2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LIPMQ5VYY2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIPMQ5VYY2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIPMQ5VYY2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIPMQ5VYY2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIPMQ5VYY2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIPMQ5VYY2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIPMQ5VYY2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIPMQ5VYY2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIPMQ5VYY2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIPMQ5VYY2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIPMQ5VYY2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIPMQ5VYY2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIPMQ5VYY2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIPMQ5VYY2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIPMQ5VYY2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LIPMQ5VYY2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIPMQ5VYY2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIPMQ5VYY2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIPMQ5VYY2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIPMQ5VYY2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIPMQ5VYY2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIPMQ5VYY2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIPMQ5VYY2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIPMQ5VYY2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIPMQ5VYY2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIPMQ5VYY2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIPMQ5VYY2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIPMQ5VYY2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIPMQ5VYY2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIPMQ5VYY2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LIPMQ5VYY2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LIPMQ5VYY2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIPMQ5VYY2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIPMQ5VYY2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIPMQ5VYY2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIPMQ5VYY2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms