Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LCN1P1Q5VSP4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCN1P1Q5VSP4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCN1P1Q5VSP4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCN1P1Q5VSP4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCN1P1Q5VSP4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCN1P1Q5VSP4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LCN1P1Q5VSP4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCN1P1Q5VSP4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LCN1P1Q5VSP4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCN1P1Q5VSP4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCN1P1Q5VSP4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCN1P1Q5VSP4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LCN1P1Q5VSP4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCN1P1Q5VSP4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LCN1P1Q5VSP4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LCN1P1Q5VSP4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LCN1P1Q5VSP4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LCN1P1Q5VSP4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LCN1P1Q5VSP4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCN1P1Q5VSP4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCN1P1Q5VSP4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCN1P1Q5VSP4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LCN1P1Q5VSP4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCN1P1Q5VSP4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCN1P1Q5VSP4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LCN1P1Q5VSP4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LCN1P1Q5VSP4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCN1P1Q5VSP4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LCN1P1Q5VSP4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCN1P1Q5VSP4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCN1P1Q5VSP4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCN1P1Q5VSP4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCN1P1Q5VSP4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LCN1P1Q5VSP4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LCN1P1Q5VSP4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCN1P1Q5VSP4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCN1P1Q5VSP4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCN1P1Q5VSP4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCN1P1Q5VSP4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCN1P1Q5VSP4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCN1P1Q5VSP4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCN1P1Q5VSP4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCN1P1Q5VSP4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LCN1P1Q5VSP4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCN1P1Q5VSP4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCN1P1Q5VSP4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCN1P1Q5VSP4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCN1P1Q5VSP4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCN1P1Q5VSP4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCN1P1Q5VSP4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCN1P1Q5VSP4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LCN1P1Q5VSP4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms