Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LINC00242Q5T6M2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00242Q5T6M2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00242Q5T6M2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LINC00242Q5T6M2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00242Q5T6M2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00242Q5T6M2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00242Q5T6M2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00242Q5T6M2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LINC00242Q5T6M2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms