Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRAPPC3LQ5T215 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TRAPPC3LQ5T215 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TRAPPC3LQ5T215 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRAPPC3LQ5T215 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRAPPC3LQ5T215 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRAPPC3LQ5T215 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRAPPC3LQ5T215 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TRAPPC3LQ5T215 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRAPPC3LQ5T215 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRAPPC3LQ5T215 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRAPPC3LQ5T215 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRAPPC3LQ5T215 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRAPPC3LQ5T215 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRAPPC3LQ5T215 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRAPPC3LQ5T215 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRAPPC3LQ5T215 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRAPPC3LQ5T215 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRAPPC3LQ5T215 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRAPPC3LQ5T215 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRAPPC3LQ5T215 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TRAPPC3LQ5T215 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TRAPPC3LQ5T215 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TRAPPC3LQ5T215 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRAPPC3LQ5T215 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRAPPC3LQ5T215 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TRAPPC3LQ5T215 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC3LQ5T215 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC3LQ5T215 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC3LQ5T215 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC3LQ5T215 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC3LQ5T215 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC3LQ5T215 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC3LQ5T215 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC3LQ5T215 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRAPPC3LQ5T215 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.78■■■■□ 3
TRAPPC3LQ5T215 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
TRAPPC3LQ5T215 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC3LQ5T215 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC3LQ5T215 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC3LQ5T215 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC3LQ5T215 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRAPPC3LQ5T215 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRAPPC3LQ5T215 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRAPPC3LQ5T215 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRAPPC3LQ5T215 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRAPPC3LQ5T215 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRAPPC3LQ5T215 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRAPPC3LQ5T215 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRAPPC3LQ5T215 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRAPPC3LQ5T215 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRAPPC3LQ5T215 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRAPPC3LQ5T215 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRAPPC3LQ5T215 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAPPC3LQ5T215 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAPPC3LQ5T215 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRAPPC3LQ5T215 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
TRAPPC3LQ5T215 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRAPPC3LQ5T215 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRAPPC3LQ5T215 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRAPPC3LQ5T215 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRAPPC3LQ5T215 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRAPPC3LQ5T215 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRAPPC3LQ5T215 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRAPPC3LQ5T215 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRAPPC3LQ5T215 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRAPPC3LQ5T215 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRAPPC3LQ5T215 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRAPPC3LQ5T215 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRAPPC3LQ5T215 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRAPPC3LQ5T215 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRAPPC3LQ5T215 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRAPPC3LQ5T215 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRAPPC3LQ5T215 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRAPPC3LQ5T215 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
TRAPPC3LQ5T215 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRAPPC3LQ5T215 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRAPPC3LQ5T215 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRAPPC3LQ5T215 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRAPPC3LQ5T215 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRAPPC3LQ5T215 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRAPPC3LQ5T215 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TRAPPC3LQ5T215 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms