Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCID2Q5JVF3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCID2Q5JVF3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCID2Q5JVF3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCID2Q5JVF3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCID2Q5JVF3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCID2Q5JVF3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCID2Q5JVF3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCID2Q5JVF3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCID2Q5JVF3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCID2Q5JVF3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCID2Q5JVF3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCID2Q5JVF3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCID2Q5JVF3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCID2Q5JVF3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCID2Q5JVF3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCID2Q5JVF3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCID2Q5JVF3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCID2Q5JVF3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCID2Q5JVF3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCID2Q5JVF3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCID2Q5JVF3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCID2Q5JVF3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCID2Q5JVF3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCID2Q5JVF3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCID2Q5JVF3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCID2Q5JVF3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCID2Q5JVF3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCID2Q5JVF3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCID2Q5JVF3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCID2Q5JVF3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCID2Q5JVF3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCID2Q5JVF3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCID2Q5JVF3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCID2Q5JVF3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCID2Q5JVF3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCID2Q5JVF3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCID2Q5JVF3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCID2Q5JVF3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCID2Q5JVF3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCID2Q5JVF3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PCID2Q5JVF3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCID2Q5JVF3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCID2Q5JVF3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCID2Q5JVF3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCID2Q5JVF3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCID2Q5JVF3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCID2Q5JVF3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCID2Q5JVF3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCID2Q5JVF3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCID2Q5JVF3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCID2Q5JVF3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCID2Q5JVF3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCID2Q5JVF3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCID2Q5JVF3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCID2Q5JVF3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCID2Q5JVF3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCID2Q5JVF3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCID2Q5JVF3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCID2Q5JVF3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCID2Q5JVF3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCID2Q5JVF3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCID2Q5JVF3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCID2Q5JVF3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCID2Q5JVF3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PCID2Q5JVF3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCID2Q5JVF3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCID2Q5JVF3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCID2Q5JVF3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCID2Q5JVF3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCID2Q5JVF3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PCID2Q5JVF3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCID2Q5JVF3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCID2Q5JVF3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCID2Q5JVF3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCID2Q5JVF3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PCID2Q5JVF3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCID2Q5JVF3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCID2Q5JVF3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCID2Q5JVF3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCID2Q5JVF3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCID2Q5JVF3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms