Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTN6

WDR38, WD repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR38Q5JTN6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
WDR38Q5JTN6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
WDR38Q5JTN6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WDR38Q5JTN6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR38Q5JTN6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR38Q5JTN6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR38Q5JTN6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR38Q5JTN6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR38Q5JTN6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR38Q5JTN6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR38Q5JTN6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR38Q5JTN6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR38Q5JTN6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR38Q5JTN6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR38Q5JTN6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR38Q5JTN6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR38Q5JTN6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR38Q5JTN6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms