Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CT47A1Q5JQC4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CT47A1Q5JQC4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CT47A1Q5JQC4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CT47A1Q5JQC4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CT47A1Q5JQC4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CT47A1Q5JQC4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CT47A1Q5JQC4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CT47A1Q5JQC4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CT47A1Q5JQC4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CT47A1Q5JQC4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CT47A1Q5JQC4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CT47A1Q5JQC4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CT47A1Q5JQC4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CT47A1Q5JQC4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CT47A1Q5JQC4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CT47A1Q5JQC4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CT47A1Q5JQC4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CT47A1Q5JQC4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CT47A1Q5JQC4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CT47A1Q5JQC4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CT47A1Q5JQC4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CT47A1Q5JQC4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CT47A1Q5JQC4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CT47A1Q5JQC4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CT47A1Q5JQC4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.24
CT47A1Q5JQC4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CT47A1Q5JQC4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CT47A1Q5JQC4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CT47A1Q5JQC4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CT47A1Q5JQC4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CT47A1Q5JQC4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CT47A1Q5JQC4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CT47A1Q5JQC4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CT47A1Q5JQC4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CT47A1Q5JQC4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CT47A1Q5JQC4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CT47A1Q5JQC4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CT47A1Q5JQC4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CT47A1Q5JQC4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CT47A1Q5JQC4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CT47A1Q5JQC4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CT47A1Q5JQC4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CT47A1Q5JQC4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CT47A1Q5JQC4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CT47A1Q5JQC4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CT47A1Q5JQC4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CT47A1Q5JQC4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CT47A1Q5JQC4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CT47A1Q5JQC4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CT47A1Q5JQC4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CT47A1Q5JQC4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CT47A1Q5JQC4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CT47A1Q5JQC4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CT47A1Q5JQC4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CT47A1Q5JQC4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CT47A1Q5JQC4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CT47A1Q5JQC4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CT47A1Q5JQC4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CT47A1Q5JQC4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CT47A1Q5JQC4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CT47A1Q5JQC4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CT47A1Q5JQC4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CT47A1Q5JQC4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CT47A1Q5JQC4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CT47A1Q5JQC4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CT47A1Q5JQC4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CT47A1Q5JQC4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CT47A1Q5JQC4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CT47A1Q5JQC4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CT47A1Q5JQC4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CT47A1Q5JQC4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CT47A1Q5JQC4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CT47A1Q5JQC4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CT47A1Q5JQC4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CT47A1Q5JQC4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CT47A1Q5JQC4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CT47A1Q5JQC4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CT47A1Q5JQC4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CT47A1Q5JQC4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CT47A1Q5JQC4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CT47A1Q5JQC4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms