Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC93Q567U6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC93Q567U6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC93Q567U6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC93Q567U6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC93Q567U6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC93Q567U6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC93Q567U6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC93Q567U6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC93Q567U6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CCDC93Q567U6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC93Q567U6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CCDC93Q567U6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CCDC93Q567U6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC93Q567U6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC93Q567U6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CCDC93Q567U6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC93Q567U6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CCDC93Q567U6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CCDC93Q567U6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CCDC93Q567U6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CCDC93Q567U6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CCDC93Q567U6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CCDC93Q567U6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CCDC93Q567U6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC93Q567U6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CCDC93Q567U6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC93Q567U6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC93Q567U6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC93Q567U6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CCDC93Q567U6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CCDC93Q567U6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCDC93Q567U6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC93Q567U6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC93Q567U6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CCDC93Q567U6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CCDC93Q567U6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC93Q567U6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC93Q567U6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC93Q567U6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC93Q567U6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC93Q567U6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC93Q567U6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CCDC93Q567U6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC93Q567U6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CCDC93Q567U6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC93Q567U6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC93Q567U6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CCDC93Q567U6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC93Q567U6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC93Q567U6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CCDC93Q567U6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC93Q567U6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC93Q567U6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CCDC93Q567U6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC93Q567U6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC93Q567U6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC93Q567U6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCDC93Q567U6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC93Q567U6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC93Q567U6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC93Q567U6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCDC93Q567U6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC93Q567U6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC93Q567U6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC93Q567U6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC93Q567U6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC93Q567U6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC93Q567U6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC93Q567U6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC93Q567U6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC93Q567U6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC93Q567U6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC93Q567U6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC93Q567U6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC93Q567U6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CCDC93Q567U6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC93Q567U6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC93Q567U6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC93Q567U6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC93Q567U6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC93Q567U6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC93Q567U6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms