Protein–RNA interactions for Protein: Q53ET0

CRTC2, CREB-regulated transcription coactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTC2Q53ET0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTC2Q53ET0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTC2Q53ET0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTC2Q53ET0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC2Q53ET0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRTC2Q53ET0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRTC2Q53ET0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRTC2Q53ET0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRTC2Q53ET0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRTC2Q53ET0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRTC2Q53ET0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRTC2Q53ET0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRTC2Q53ET0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRTC2Q53ET0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRTC2Q53ET0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRTC2Q53ET0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRTC2Q53ET0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CRTC2Q53ET0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRTC2Q53ET0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRTC2Q53ET0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRTC2Q53ET0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRTC2Q53ET0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRTC2Q53ET0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRTC2Q53ET0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRTC2Q53ET0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CRTC2Q53ET0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRTC2Q53ET0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRTC2Q53ET0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTC2Q53ET0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRTC2Q53ET0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRTC2Q53ET0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRTC2Q53ET0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRTC2Q53ET0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRTC2Q53ET0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRTC2Q53ET0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms