Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TPRNQ4KMQ1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TPRNQ4KMQ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TPRNQ4KMQ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TPRNQ4KMQ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TPRNQ4KMQ1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TPRNQ4KMQ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TPRNQ4KMQ1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TPRNQ4KMQ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TPRNQ4KMQ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TPRNQ4KMQ1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TPRNQ4KMQ1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TPRNQ4KMQ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TPRNQ4KMQ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TPRNQ4KMQ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TPRNQ4KMQ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TPRNQ4KMQ1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TPRNQ4KMQ1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TPRNQ4KMQ1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TPRNQ4KMQ1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TPRNQ4KMQ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TPRNQ4KMQ1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TPRNQ4KMQ1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TPRNQ4KMQ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TPRNQ4KMQ1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TPRNQ4KMQ1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TPRNQ4KMQ1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TPRNQ4KMQ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TPRNQ4KMQ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TPRNQ4KMQ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TPRNQ4KMQ1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TPRNQ4KMQ1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TPRNQ4KMQ1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TPRNQ4KMQ1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TPRNQ4KMQ1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TPRNQ4KMQ1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TPRNQ4KMQ1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TPRNQ4KMQ1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TPRNQ4KMQ1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TPRNQ4KMQ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TPRNQ4KMQ1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TPRNQ4KMQ1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TPRNQ4KMQ1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TPRNQ4KMQ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TPRNQ4KMQ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TPRNQ4KMQ1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TPRNQ4KMQ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TPRNQ4KMQ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TPRNQ4KMQ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TPRNQ4KMQ1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TPRNQ4KMQ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TPRNQ4KMQ1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TPRNQ4KMQ1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TPRNQ4KMQ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TPRNQ4KMQ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TPRNQ4KMQ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TPRNQ4KMQ1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TPRNQ4KMQ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TPRNQ4KMQ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TPRNQ4KMQ1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TPRNQ4KMQ1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TPRNQ4KMQ1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
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