Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI67

KRTAP6-3, Keratin-associated protein 6-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP6-3Q3LI67 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP6-3Q3LI67 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP6-3Q3LI67 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP6-3Q3LI67 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
KRTAP6-3Q3LI67 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP6-3Q3LI67 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP6-3Q3LI67 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP6-3Q3LI67 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP6-3Q3LI67 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP6-3Q3LI67 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP6-3Q3LI67 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP6-3Q3LI67 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP6-3Q3LI67 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms