Protein–RNA interactions for Protein: Q32NB8

PGS1, CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1Q32NB8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGS1Q32NB8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGS1Q32NB8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGS1Q32NB8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PGS1Q32NB8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGS1Q32NB8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGS1Q32NB8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGS1Q32NB8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGS1Q32NB8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGS1Q32NB8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGS1Q32NB8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGS1Q32NB8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGS1Q32NB8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGS1Q32NB8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGS1Q32NB8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGS1Q32NB8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PGS1Q32NB8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGS1Q32NB8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGS1Q32NB8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGS1Q32NB8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGS1Q32NB8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms