Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP5B1Q2VPB7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP5B1Q2VPB7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP5B1Q2VPB7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AP5B1Q2VPB7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP5B1Q2VPB7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP5B1Q2VPB7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP5B1Q2VPB7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP5B1Q2VPB7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP5B1Q2VPB7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP5B1Q2VPB7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP5B1Q2VPB7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP5B1Q2VPB7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP5B1Q2VPB7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP5B1Q2VPB7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP5B1Q2VPB7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP5B1Q2VPB7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP5B1Q2VPB7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP5B1Q2VPB7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP5B1Q2VPB7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP5B1Q2VPB7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AP5B1Q2VPB7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms