Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IMPG1Q17R60 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IMPG1Q17R60 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IMPG1Q17R60 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IMPG1Q17R60 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IMPG1Q17R60 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IMPG1Q17R60 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IMPG1Q17R60 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IMPG1Q17R60 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IMPG1Q17R60 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IMPG1Q17R60 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IMPG1Q17R60 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IMPG1Q17R60 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IMPG1Q17R60 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IMPG1Q17R60 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IMPG1Q17R60 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IMPG1Q17R60 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IMPG1Q17R60 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IMPG1Q17R60 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IMPG1Q17R60 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IMPG1Q17R60 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IMPG1Q17R60 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IMPG1Q17R60 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IMPG1Q17R60 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IMPG1Q17R60 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IMPG1Q17R60 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IMPG1Q17R60 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IMPG1Q17R60 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IMPG1Q17R60 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IMPG1Q17R60 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IMPG1Q17R60 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IMPG1Q17R60 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IMPG1Q17R60 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IMPG1Q17R60 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IMPG1Q17R60 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IMPG1Q17R60 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IMPG1Q17R60 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
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