Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRF1Q16656 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRF1Q16656 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRF1Q16656 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRF1Q16656 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRF1Q16656 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRF1Q16656 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NRF1Q16656 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRF1Q16656 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRF1Q16656 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRF1Q16656 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRF1Q16656 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRF1Q16656 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRF1Q16656 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRF1Q16656 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRF1Q16656 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRF1Q16656 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRF1Q16656 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRF1Q16656 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRF1Q16656 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRF1Q16656 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRF1Q16656 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRF1Q16656 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRF1Q16656 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRF1Q16656 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRF1Q16656 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NRF1Q16656 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRF1Q16656 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRF1Q16656 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRF1Q16656 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRF1Q16656 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRF1Q16656 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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NRF1Q16656 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NRF1Q16656 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRF1Q16656 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NRF1Q16656 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRF1Q16656 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRF1Q16656 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NRF1Q16656 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRF1Q16656 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRF1Q16656 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRF1Q16656 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRF1Q16656 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRF1Q16656 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NRF1Q16656 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NRF1Q16656 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRF1Q16656 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NRF1Q16656 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRF1Q16656 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NRF1Q16656 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NRF1Q16656 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.1 ms