Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAMK4Q16566 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CAMK4Q16566 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAMK4Q16566 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAMK4Q16566 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAMK4Q16566 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CAMK4Q16566 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAMK4Q16566 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAMK4Q16566 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAMK4Q16566 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CAMK4Q16566 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAMK4Q16566 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CAMK4Q16566 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAMK4Q16566 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAMK4Q16566 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CAMK4Q16566 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAMK4Q16566 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAMK4Q16566 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAMK4Q16566 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CAMK4Q16566 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CAMK4Q16566 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CAMK4Q16566 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAMK4Q16566 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAMK4Q16566 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAMK4Q16566 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAMK4Q16566 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CAMK4Q16566 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAMK4Q16566 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CAMK4Q16566 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CAMK4Q16566 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CAMK4Q16566 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CAMK4Q16566 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CAMK4Q16566 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMK4Q16566 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMK4Q16566 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMK4Q16566 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMK4Q16566 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CAMK4Q16566 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAMK4Q16566 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAMK4Q16566 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAMK4Q16566 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAMK4Q16566 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CAMK4Q16566 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMK4Q16566 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CAMK4Q16566 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CAMK4Q16566 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAMK4Q16566 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAMK4Q16566 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CAMK4Q16566 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CAMK4Q16566 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMK4Q16566 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMK4Q16566 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMK4Q16566 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMK4Q16566 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CAMK4Q16566 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAMK4Q16566 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CAMK4Q16566 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMK4Q16566 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CAMK4Q16566 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMK4Q16566 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMK4Q16566 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CAMK4Q16566 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CAMK4Q16566 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CAMK4Q16566 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAMK4Q16566 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAMK4Q16566 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAMK4Q16566 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAMK4Q16566 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAMK4Q16566 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CAMK4Q16566 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CAMK4Q16566 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAMK4Q16566 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CAMK4Q16566 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAMK4Q16566 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CAMK4Q16566 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CAMK4Q16566 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CAMK4Q16566 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAMK4Q16566 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAMK4Q16566 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CAMK4Q16566 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CAMK4Q16566 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CAMK4Q16566 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CAMK4Q16566 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CAMK4Q16566 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMK4Q16566 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAMK4Q16566 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAMK4Q16566 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAMK4Q16566 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CAMK4Q16566 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CAMK4Q16566 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMK4Q16566 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMK4Q16566 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CAMK4Q16566 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMK4Q16566 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMK4Q16566 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMK4Q16566 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMK4Q16566 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAMK4Q16566 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAMK4Q16566 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAMK4Q16566 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms