Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL23Q16540 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL23Q16540 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRPL23Q16540 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL23Q16540 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL23Q16540 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms