Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDCD2Q16342 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCD2Q16342 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD2Q16342 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD2Q16342 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD2Q16342 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD2Q16342 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCD2Q16342 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD2Q16342 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD2Q16342 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD2Q16342 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD2Q16342 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD2Q16342 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD2Q16342 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PDCD2Q16342 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDCD2Q16342 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDCD2Q16342 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDCD2Q16342 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDCD2Q16342 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDCD2Q16342 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCD2Q16342 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCD2Q16342 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCD2Q16342 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDCD2Q16342 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCD2Q16342 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCD2Q16342 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCD2Q16342 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDCD2Q16342 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCD2Q16342 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDCD2Q16342 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCD2Q16342 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCD2Q16342 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCD2Q16342 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDCD2Q16342 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDCD2Q16342 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCD2Q16342 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCD2Q16342 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCD2Q16342 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCD2Q16342 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCD2Q16342 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCD2Q16342 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCD2Q16342 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCD2Q16342 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCD2Q16342 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCD2Q16342 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCD2Q16342 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD2Q16342 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD2Q16342 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD2Q16342 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCD2Q16342 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDCD2Q16342 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCD2Q16342 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCD2Q16342 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCD2Q16342 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCD2Q16342 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCD2Q16342 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD2Q16342 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD2Q16342 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD2Q16342 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD2Q16342 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD2Q16342 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD2Q16342 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD2Q16342 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCD2Q16342 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDCD2Q16342 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDCD2Q16342 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDCD2Q16342 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDCD2Q16342 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCD2Q16342 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCD2Q16342 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD2Q16342 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD2Q16342 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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