Protein–RNA interactions for Protein: Q15031

LARS2, Probable leucine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARS2Q15031 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARS2Q15031 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LARS2Q15031 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARS2Q15031 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARS2Q15031 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARS2Q15031 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARS2Q15031 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARS2Q15031 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARS2Q15031 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LARS2Q15031 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LARS2Q15031 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARS2Q15031 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LARS2Q15031 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARS2Q15031 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARS2Q15031 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARS2Q15031 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARS2Q15031 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARS2Q15031 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARS2Q15031 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARS2Q15031 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LARS2Q15031 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARS2Q15031 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARS2Q15031 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARS2Q15031 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARS2Q15031 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARS2Q15031 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LARS2Q15031 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LARS2Q15031 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LARS2Q15031 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LARS2Q15031 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LARS2Q15031 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARS2Q15031 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARS2Q15031 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LARS2Q15031 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARS2Q15031 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LARS2Q15031 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARS2Q15031 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARS2Q15031 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARS2Q15031 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LARS2Q15031 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LARS2Q15031 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LARS2Q15031 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LARS2Q15031 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARS2Q15031 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LARS2Q15031 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms