Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 FBL-203ENST00000594309 603 ntTSL 223.79■■□□□ 1.42e-18■■■■■ 43.9
NOLC1Q14978 FBL-211ENST00000601274 877 ntTSL 523.79■■□□□ 1.42e-18■■■■■ 43.9
NOLC1Q14978 FBL-209ENST00000599134 500 ntTSL 522.5■■□□□ 1.192e-18■■■■■ 43.9
NOLC1Q14978 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.116e-15■■■■■ 43.9
NOLC1Q14978 FBL-208ENST00000598417 581 ntTSL 520.48■□□□□ 0.872e-18■■■■■ 43.9
NOLC1Q14978 FBL-207ENST00000597634 726 ntTSL 516.58■□□□□ 0.242e-18■■■■■ 43.9
NOLC1Q14978 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.129e-9■■■■■ 43.9
NOLC1Q14978 FBL-204ENST00000594443 805 ntTSL 313.79□□□□□ -0.26e-15■■■■■ 43.9
NOLC1Q14978 FBL-206ENST00000597224 732 ntTSL 39.28□□□□□ -0.929e-9■■■■■ 43.9
NOLC1Q14978 ACACA-228ENST00000613146 3974 ntTSL 1 (best)8.62□□□□□ -1.039e-9■■■■■ 43.9
NOLC1Q14978 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.119e-9■■■■■ 43.9
NOLC1Q14978 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.169e-9■■■■■ 43.9
NOLC1Q14978 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.259e-9■■■■■ 43.9
NOLC1Q14978 SNHG19-201ENST00000563192 342 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 43.9
NOLC1Q14978 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.391e-323■■■■■ 43.9
NOLC1Q14978 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.521e-323■■■■■ 43.9
NOLC1Q14978 DHX15-201ENST00000336812 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.263e-15■■■■■ 43.4
NOLC1Q14978 DHX15-206ENST00000510645 470 ntTSL 58.38□□□□□ -1.073e-15■■■■■ 43.4
NOLC1Q14978 DHX15-209ENST00000513036 1848 ntTSL 26.8□□□□□ -1.323e-15■■■■■ 43.4
NOLC1Q14978 DHX15-208ENST00000512903 2071 ntTSL 25.62□□□□□ -1.513e-15■■■■■ 43.4
NOLC1Q14978 DHX15-204ENST00000508032 3028 ntTSL 1 (best)4.61□□□□□ -1.673e-15■■■■■ 43.4
NOLC1Q14978 PLEKHA2-203ENST00000519640 565 ntTSL 521.09■□□□□ 0.973e-12■■■■■ 43.4
NOLC1Q14978 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.953e-12■■■■■ 43.4
NOLC1Q14978 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.463e-12■■■■■ 43.4
NOLC1Q14978 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.013e-12■■■■■ 43.4
NOLC1Q14978 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.13e-12■■■■■ 43.4
NOLC1Q14978 SFT2D1-202ENST00000478705 659 ntTSL 218.02■□□□□ 0.488e-13■■■■■ 43.1
NOLC1Q14978 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.378e-13■■■■■ 43.1
NOLC1Q14978 SFT2D1-204ENST00000487841 2576 ntTSL 1 (best)14.91□□□□□ -0.028e-13■■■■■ 43.1
NOLC1Q14978 SFT2D1-203ENST00000479490 2061 ntTSL 1 (best)13.59□□□□□ -0.238e-13■■■■■ 43.1
NOLC1Q14978 GTF2A1-201ENST00000298173 1677 ntTSL 226.79■■□□□ 1.882e-26■■■■■ 43.1
NOLC1Q14978 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.682e-26■■■■■ 43.1
NOLC1Q14978 GTF2A1-204ENST00000556268 864 ntTSL 59.68□□□□□ -0.862e-26■■■■■ 43.1
NOLC1Q14978 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.212e-26■■■■■ 43.1
NOLC1Q14978 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.6□□□□□ -1.992e-26■■■■■ 43.1
NOLC1Q14978 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.8□□□□□ -1.81e-323■■■■■ 43
NOLC1Q14978 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 43
NOLC1Q14978 ATP5G3-205ENST00000497075 1313 ntTSL 214.72□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 43
NOLC1Q14978 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 43
NOLC1Q14978 ATP5G3-203ENST00000409194 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 43
NOLC1Q14978 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.252e-75■■■■■ 42.9
NOLC1Q14978 SNHG14-218ENST00000553108 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.093e-10■■■■■ 42.1
NOLC1Q14978 SNHG14-210ENST00000546682 8842 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.573e-10■■■■■ 41.7
NOLC1Q14978 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.192e-22■■■■■ 41.7
NOLC1Q14978 LDHB-209ENST00000542765 672 ntTSL 24.85□□□□□ -1.639e-8■■■■■ 41.6
NOLC1Q14978 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.751e-323■■■■■ 41.6
NOLC1Q14978 RPL17-219ENST00000584364 523 ntTSL 25.22□□□□□ -1.573e-31■■■■■ 41.6
NOLC1Q14978 RPL17-214ENST00000582588 401 ntTSL 23.61□□□□□ -1.831e-323■■■■■ 41.6
NOLC1Q14978 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.36□□□□□ -2.031e-323■■■■■ 41.6
NOLC1Q14978 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.471e-9■■■■■ 41.4
NOLC1Q14978 SNHG1-221ENST00000544983 870 ntTSL 212.86□□□□□ -0.356e-19■■■■■ 41.4
NOLC1Q14978 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.187e-12■■■■■ 40.9
NOLC1Q14978 ACAT1-210ENST00000533597 558 ntTSL 26.64□□□□□ -1.357e-12■■■■■ 40.9
NOLC1Q14978 ACER3-214ENST00000534206 834 ntTSL 531.03■■■□□ 2.562e-7■■■■■ 40.8
NOLC1Q14978 ACER3-211ENST00000531461 1292 ntTSL 226.25■■□□□ 1.792e-7■■■■■ 40.8
NOLC1Q14978 ACER3-207ENST00000530182 551 ntTSL 526.2■■□□□ 1.782e-7■■■■■ 40.8
NOLC1Q14978 ACER3-204ENST00000525861 2058 ntTSL 225.75■■□□□ 1.712e-7■■■■■ 40.8
NOLC1Q14978 ACER3-202ENST00000525194 846 ntTSL 1 (best)24.09■■□□□ 1.452e-7■■■■■ 40.8
NOLC1Q14978 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 40.8
NOLC1Q14978 ACER3-201ENST00000278544 3500 ntTSL 1 (best)14.46□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 40.8
NOLC1Q14978 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 40.8
NOLC1Q14978 ACER3-210ENST00000531352 2093 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 40.8
NOLC1Q14978 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.822e-7■■■■■ 40.8
NOLC1Q14978 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 40.8
NOLC1Q14978 ACER3-208ENST00000530334 931 ntTSL 26.37□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 40.8
NOLC1Q14978 EIF4G2-218ENST00000531416 1969 ntTSL 217.2■□□□□ 0.341e-323■■■■■ 40.7
NOLC1Q14978 EIF4G2-201ENST00000339995 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.611e-323■■■■■ 40.7
NOLC1Q14978 EIF4G2-225ENST00000532383 6769 ntTSL 1 (best)10.67□□□□□ -0.71e-323■■■■■ 40.7
NOLC1Q14978 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.721e-323■■■■■ 40.7
NOLC1Q14978 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.831e-323■■■■■ 40.7
NOLC1Q14978 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.891e-323■■■■■ 40.7
NOLC1Q14978 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.011e-323■■■■■ 40.7
NOLC1Q14978 EIF4G2-215ENST00000530564 849 ntTSL 27.67□□□□□ -1.181e-323■■■■■ 40.7
NOLC1Q14978 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.45□□□□□ -1.71e-323■■■■■ 40.7
NOLC1Q14978 EIF4G2-222ENST00000532120 223 ntTSL 33.48□□□□□ -1.851e-323■■■■■ 40.7
NOLC1Q14978 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.612e-37■■■■■ 40.6
NOLC1Q14978 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.612e-37■■■■■ 40.6
NOLC1Q14978 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.142e-37■■■■■ 40.6
NOLC1Q14978 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.75□□□□□ -1.652e-37■■■■■ 40.6
NOLC1Q14978 RPL13A-203ENST00000468655 407 ntTSL 211.61□□□□□ -0.551e-323■■■■■ 40.3
NOLC1Q14978 EIF4A2-209ENST00000461021 575 ntTSL 26.42□□□□□ -1.389e-9■■■■■ 40.3
NOLC1Q14978 TUBA1B-201ENST00000332858 3198 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.131e-19■■■■■ 40.2
NOLC1Q14978 TUBA1B-204ENST00000547765 1875 ntTSL 515.72■□□□□ 0.111e-19■■■■■ 40.2
NOLC1Q14978 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.011e-19■■■■■ 40.2
NOLC1Q14978 ZFAS1-210ENST00000623640 732 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.653e-12■■■■■ 40.2
NOLC1Q14978 RPS27A-206ENST00000468810 597 ntTSL 310.26□□□□□ -0.779e-18■■■■■ 40.2
NOLC1Q14978 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 40.2
NOLC1Q14978 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.531e-7■■■■■ 40.2
NOLC1Q14978 RPL4-202ENST00000561554 580 ntTSL 411.79□□□□□ -0.522e-9■■■■■ 40.2
NOLC1Q14978 RPL4-213ENST00000566624 819 ntTSL 211.57□□□□□ -0.562e-9■■■■■ 40.2
NOLC1Q14978 PRRC2B-201ENST00000320547 4950 ntTSL 213.3□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 39.7
NOLC1Q14978 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.351e-323■■■■■ 39.7
NOLC1Q14978 PSMB1-201ENST00000262193 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.478e-11■■■■■ 39.7
NOLC1Q14978 PSMB1-202ENST00000462957 1939 ntTSL 26.34□□□□□ -1.398e-11■■■■■ 39.7
NOLC1Q14978 PHB2-208ENST00000543465 1518 ntTSL 524.57■■□□□ 1.527e-11■■■■■ 39.6
NOLC1Q14978 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.27e-11■■■■■ 39.6
NOLC1Q14978 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.137e-11■■■■■ 39.6
NOLC1Q14978 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.891e-323■■■■■ 39.6
NOLC1Q14978 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.887e-11■■■■■ 39.6
NOLC1Q14978 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.757e-11■■■■■ 39.6
Retrieved 100 of 7,921 protein–RNA pairs in 35.9 ms