RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298173.7

GTF2A1-201, Transcript of general transcription factor IIA subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene GTF2A1, Length 1,677 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1-201ENST00000298173 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.1■■■■■ 6.73
GTF2A1-201ENST00000298173 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.05■■■■■ 5.6
GTF2A1-201ENST00000298173 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.86■■■■■ 5.25
GTF2A1-201ENST00000298173 ABCC9O60706 1549 aa47.66■■■■■ 5.22
GTF2A1-201ENST00000298173 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.29■■■■■ 5.16
GTF2A1-201ENST00000298173 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.15■■■■■ 5.14
GTF2A1-201ENST00000298173 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.94■■■■■ 5.11
GTF2A1-201ENST00000298173 NACADO15069 1562 aa46.74■■■■■ 5.07
GTF2A1-201ENST00000298173 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.41■■■■■ 5.02
GTF2A1-201ENST00000298173 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.03■■■■■ 4.96
GTF2A1-201ENST00000298173 SCRIBQ14160 1630 aa45.83■■■■■ 4.93
GTF2A1-201ENST00000298173 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.49■■■■■ 4.87
GTF2A1-201ENST00000298173 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.06■■■■■ 4.8
GTF2A1-201ENST00000298173 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.84■■■■■ 4.77
GTF2A1-201ENST00000298173 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.38■■■■■ 4.7
GTF2A1-201ENST00000298173 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.11■■■■■ 4.65
GTF2A1-201ENST00000298173 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.09■■■■■ 4.65
GTF2A1-201ENST00000298173 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.64
GTF2A1-201ENST00000298173 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.06■■■■■ 4.64
GTF2A1-201ENST00000298173 SMARCA4P51532 1647 aa43.98■■■■■ 4.63
GTF2A1-201ENST00000298173 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
GTF2A1-201ENST00000298173 WIZO95785 1651 aa43.66■■■■■ 4.58
GTF2A1-201ENST00000298173 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.54■■■■■ 4.56
GTF2A1-201ENST00000298173 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.4■■■■■ 4.54
GTF2A1-201ENST00000298173 SMARCA2P51531 1590 aa43.35■■■■■ 4.53
GTF2A1-201ENST00000298173 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
GTF2A1-201ENST00000298173 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.18■■■■■ 4.5
GTF2A1-201ENST00000298173 NCAPD3P42695 1498 aa43.16■■■■■ 4.5
GTF2A1-201ENST00000298173 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.49
GTF2A1-201ENST00000298173 HMGXB3Q12766 1538 aa43.02■■■■■ 4.48
GTF2A1-201ENST00000298173 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.77■■■■■ 4.44
GTF2A1-201ENST00000298173 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.57■■■■■ 4.41
GTF2A1-201ENST00000298173 CFTRP13569 1480 aa42.04■■■■■ 4.32
GTF2A1-201ENST00000298173 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.03■■■■■ 4.32
GTF2A1-201ENST00000298173 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.98■■■■■ 4.31
GTF2A1-201ENST00000298173 PRDM2Q13029 1718 aa41.78■■■■■ 4.28
GTF2A1-201ENST00000298173 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.74■■■■■ 4.27
GTF2A1-201ENST00000298173 NESP48681 1621 aa41.71■■■■■ 4.27
GTF2A1-201ENST00000298173 ABCC8Q09428 1581 aa41.64■■■■■ 4.26
GTF2A1-201ENST00000298173 TRIM41Q8WV44 630 aa41.53■■■■■ 4.24
GTF2A1-201ENST00000298173 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.48■■■■■ 4.23
GTF2A1-201ENST00000298173 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.47■■■■■ 4.23
GTF2A1-201ENST00000298173 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.4■■■■■ 4.22
GTF2A1-201ENST00000298173 SYNJ1O43426 1573 aa41.32■■■■■ 4.21
GTF2A1-201ENST00000298173 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.24■■■■■ 4.19
GTF2A1-201ENST00000298173 TOP2BQ02880 1626 aa41.23■■■■■ 4.19
GTF2A1-201ENST00000298173 CUX1P39880 1505 aa41.23■■■■■ 4.19
GTF2A1-201ENST00000298173 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.23■■■■■ 4.19
GTF2A1-201ENST00000298173 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.21■■■■■ 4.19
GTF2A1-201ENST00000298173 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.02■■■■■ 4.16
GTF2A1-201ENST00000298173 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
GTF2A1-201ENST00000298173 TOPBP1Q92547 1522 aa40.98■■■■■ 4.15
GTF2A1-201ENST00000298173 ERCC6Q03468 1493 aa40.89■■■■■ 4.14
GTF2A1-201ENST00000298173 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.89■■■■■ 4.14
GTF2A1-201ENST00000298173 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.83■■■■■ 4.13
GTF2A1-201ENST00000298173 SOGA1O94964 1423 aa40.79■■■■■ 4.12
GTF2A1-201ENST00000298173 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
GTF2A1-201ENST00000298173 WDR62O43379 1518 aa40.72■■■■■ 4.11
GTF2A1-201ENST00000298173 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
GTF2A1-201ENST00000298173 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.68■■■■■ 4.1
GTF2A1-201ENST00000298173 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
GTF2A1-201ENST00000298173 EEA1Q15075 1411 aa40.65■■■■■ 4.1
GTF2A1-201ENST00000298173 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.58■■■■■ 4.09
GTF2A1-201ENST00000298173 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.52■■■■■ 4.08
GTF2A1-201ENST00000298173 CUX2O14529 1486 aa40.49■■■■■ 4.07
GTF2A1-201ENST00000298173 KIF27Q86VH2 1401 aa40.48■■■■■ 4.07
GTF2A1-201ENST00000298173 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.47■■■■■ 4.07
GTF2A1-201ENST00000298173 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
GTF2A1-201ENST00000298173 WDR97A6NE52 1622 aa40.43■■■■■ 4.06
GTF2A1-201ENST00000298173 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.35■■■■■ 4.05
GTF2A1-201ENST00000298173 IFT140Q96RY7 1462 aa40.33■■■■■ 4.05
GTF2A1-201ENST00000298173 IGF1RP08069 1367 aa40.23■■■■■ 4.03
GTF2A1-201ENST00000298173 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
GTF2A1-201ENST00000298173 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.22■■■■■ 4.03
GTF2A1-201ENST00000298173 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.14■■■■■ 4.02
GTF2A1-201ENST00000298173 KIF21BO75037 1637 aa40.13■■■■■ 4.02
GTF2A1-201ENST00000298173 PRXQ9BXM0 1461 aa40.12■■■■■ 4.01
GTF2A1-201ENST00000298173 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
GTF2A1-201ENST00000298173 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.06■■■■■ 42e-6■□□□□ 11.3
GTF2A1-201ENST00000298173 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.04■■■■■ 4
GTF2A1-201ENST00000298173 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.02■■■■■ 4
GTF2A1-201ENST00000298173 GOLGA3Q08378 1498 aa40.01■■■■□ 3.99
GTF2A1-201ENST00000298173 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.98■■■■□ 3.99
GTF2A1-201ENST00000298173 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.97■■■■□ 3.99
GTF2A1-201ENST00000298173 PBRM1Q86U86 1689 aa39.94■■■■□ 3.98
GTF2A1-201ENST00000298173 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
GTF2A1-201ENST00000298173 CUL7Q14999 1698 aa39.92■■■■□ 3.98
GTF2A1-201ENST00000298173 GRIN2BQ13224 1484 aa39.91■■■■□ 3.98
GTF2A1-201ENST00000298173 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.84■■■■□ 3.97
GTF2A1-201ENST00000298173 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
GTF2A1-201ENST00000298173 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.71■■■■□ 3.95
GTF2A1-201ENST00000298173 ADAMTS12P58397 1594 aa39.7■■■■□ 3.95
GTF2A1-201ENST00000298173 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.66■■■■□ 3.94
GTF2A1-201ENST00000298173 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
GTF2A1-201ENST00000298173 CEP162Q5TB80 1403 aa39.52■■■■□ 3.92
GTF2A1-201ENST00000298173 SYNJ2O15056 1496 aa39.49■■■■□ 3.91
GTF2A1-201ENST00000298173 GRIN2AQ12879 1464 aa39.41■■■■□ 3.9
GTF2A1-201ENST00000298173 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.39■■■■□ 3.9
GTF2A1-201ENST00000298173 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
GTF2A1-201ENST00000298173 CLIP1P30622 1438 aa39.35■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 843 ms