Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSAMPQ13449 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSAMPQ13449 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSAMPQ13449 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSAMPQ13449 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSAMPQ13449 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LSAMPQ13449 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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