Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATMQ13315 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATMQ13315 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATMQ13315 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATMQ13315 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATMQ13315 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATMQ13315 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATMQ13315 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATMQ13315 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATMQ13315 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATMQ13315 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATMQ13315 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATMQ13315 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATMQ13315 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATMQ13315 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATMQ13315 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATMQ13315 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATMQ13315 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATMQ13315 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATMQ13315 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATMQ13315 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATMQ13315 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATMQ13315 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATMQ13315 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATMQ13315 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATMQ13315 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATMQ13315 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATMQ13315 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATMQ13315 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATMQ13315 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATMQ13315 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATMQ13315 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATMQ13315 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATMQ13315 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATMQ13315 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATMQ13315 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATMQ13315 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATMQ13315 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATMQ13315 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATMQ13315 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATMQ13315 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATMQ13315 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATMQ13315 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATMQ13315 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATMQ13315 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATMQ13315 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATMQ13315 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATMQ13315 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATMQ13315 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATMQ13315 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATMQ13315 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATMQ13315 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATMQ13315 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATMQ13315 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATMQ13315 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATMQ13315 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATMQ13315 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATMQ13315 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATMQ13315 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATMQ13315 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATMQ13315 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATMQ13315 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATMQ13315 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATMQ13315 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATMQ13315 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATMQ13315 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATMQ13315 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATMQ13315 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATMQ13315 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATMQ13315 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATMQ13315 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATMQ13315 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATMQ13315 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATMQ13315 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATMQ13315 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATMQ13315 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATMQ13315 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATMQ13315 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATMQ13315 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATMQ13315 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATMQ13315 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATMQ13315 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATMQ13315 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATMQ13315 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATMQ13315 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATMQ13315 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATMQ13315 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATMQ13315 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATMQ13315 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATMQ13315 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATMQ13315 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATMQ13315 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATMQ13315 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATMQ13315 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATMQ13315 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATMQ13315 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATMQ13315 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATMQ13315 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATMQ13315 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATMQ13315 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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