Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME3Q13232 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME3Q13232 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME3Q13232 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME3Q13232 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NME3Q13232 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME3Q13232 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME3Q13232 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME3Q13232 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME3Q13232 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NME3Q13232 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NME3Q13232 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NME3Q13232 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME3Q13232 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME3Q13232 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NME3Q13232 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NME3Q13232 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NME3Q13232 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NME3Q13232 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NME3Q13232 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NME3Q13232 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NME3Q13232 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NME3Q13232 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NME3Q13232 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NME3Q13232 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME3Q13232 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME3Q13232 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NME3Q13232 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NME3Q13232 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NME3Q13232 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NME3Q13232 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NME3Q13232 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NME3Q13232 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NME3Q13232 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NME3Q13232 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NME3Q13232 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME3Q13232 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NME3Q13232 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NME3Q13232 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME3Q13232 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME3Q13232 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NME3Q13232 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NME3Q13232 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NME3Q13232 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NME3Q13232 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NME3Q13232 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NME3Q13232 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NME3Q13232 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NME3Q13232 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NME3Q13232 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NME3Q13232 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NME3Q13232 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NME3Q13232 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NME3Q13232 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NME3Q13232 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NME3Q13232 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NME3Q13232 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NME3Q13232 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NME3Q13232 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NME3Q13232 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NME3Q13232 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NME3Q13232 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NME3Q13232 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NME3Q13232 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NME3Q13232 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NME3Q13232 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NME3Q13232 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NME3Q13232 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NME3Q13232 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NME3Q13232 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NME3Q13232 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NME3Q13232 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NME3Q13232 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NME3Q13232 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NME3Q13232 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NME3Q13232 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NME3Q13232 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NME3Q13232 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NME3Q13232 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NME3Q13232 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NME3Q13232 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME3Q13232 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME3Q13232 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME3Q13232 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME3Q13232 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NME3Q13232 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NME3Q13232 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NME3Q13232 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NME3Q13232 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NME3Q13232 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME3Q13232 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME3Q13232 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME3Q13232 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NME3Q13232 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NME3Q13232 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME3Q13232 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME3Q13232 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME3Q13232 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NME3Q13232 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME3Q13232 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
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