Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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