Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYO1EQ12965 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYO1EQ12965 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO1EQ12965 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO1EQ12965 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO1EQ12965 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO1EQ12965 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO1EQ12965 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO1EQ12965 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO1EQ12965 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO1EQ12965 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO1EQ12965 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO1EQ12965 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO1EQ12965 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO1EQ12965 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO1EQ12965 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO1EQ12965 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO1EQ12965 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MYO1EQ12965 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYO1EQ12965 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYO1EQ12965 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MYO1EQ12965 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYO1EQ12965 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYO1EQ12965 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYO1EQ12965 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYO1EQ12965 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYO1EQ12965 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYO1EQ12965 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYO1EQ12965 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYO1EQ12965 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYO1EQ12965 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYO1EQ12965 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYO1EQ12965 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYO1EQ12965 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYO1EQ12965 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYO1EQ12965 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYO1EQ12965 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYO1EQ12965 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYO1EQ12965 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYO1EQ12965 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYO1EQ12965 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYO1EQ12965 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYO1EQ12965 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYO1EQ12965 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYO1EQ12965 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MYO1EQ12965 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYO1EQ12965 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYO1EQ12965 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYO1EQ12965 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYO1EQ12965 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYO1EQ12965 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYO1EQ12965 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYO1EQ12965 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYO1EQ12965 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYO1EQ12965 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYO1EQ12965 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYO1EQ12965 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYO1EQ12965 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYO1EQ12965 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYO1EQ12965 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MYO1EQ12965 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYO1EQ12965 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO1EQ12965 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO1EQ12965 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO1EQ12965 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO1EQ12965 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO1EQ12965 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MYO1EQ12965 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO1EQ12965 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO1EQ12965 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO1EQ12965 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MYO1EQ12965 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MYO1EQ12965 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYO1EQ12965 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYO1EQ12965 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MYO1EQ12965 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MYO1EQ12965 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYO1EQ12965 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MYO1EQ12965 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms