Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 PAM-202ENST00000345721 3684 ntTSL 211.82□□□□□ -0.521e-10■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 COPA-205ENST00000541366 616 ntTSL 211.8□□□□□ -0.521e-10■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.61e-10■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 UBE3A-221ENST00000630607 1873 ntTSL 36.97□□□□□ -1.291e-10■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 PAM-205ENST00000379799 2567 ntTSL 56.6□□□□□ -1.351e-10■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 PAM-211ENST00000505372 857 ntTSL 24.87□□□□□ -1.631e-10■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 UBE3A-217ENST00000628890 424 ntTSL 33.74□□□□□ -1.811e-10■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 UBE3A-210ENST00000626068 772 ntTSL 23.66□□□□□ -1.821e-10■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 SRP68-206ENST00000587864 577 ntTSL 23.21□□□□□ -1.92e-7■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 SRP68-204ENST00000585539 254 ntTSL 53.21□□□□□ -1.92e-7■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.877e-7■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 CPNE1-212ENST00000430570 1332 ntTSL 524.79■■□□□ 1.567e-7■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 CPNE1-205ENST00000401607 1795 ntTSL 524.62■■□□□ 1.537e-7■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 CPNE1-216ENST00000437340 1755 ntTSL 1 (best)24.4■■□□□ 1.57e-7■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.197e-7■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 520.66■□□□□ 0.97e-7■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 517.57■□□□□ 0.47e-7■■■■■ 35.6
ILF3Q12906 CEP250-208ENST00000446710 868 ntTSL 1 (best)15.81■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 35.5
ILF3Q12906 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 35.5
ILF3Q12906 CEP250-203ENST00000420564 702 ntTSL 513.44□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 35.5
ILF3Q12906 CEP250-207ENST00000425934 2156 ntTSL 513.13□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 35.5
ILF3Q12906 CEP250-209ENST00000461386 2295 ntTSL 212.49□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 35.5
ILF3Q12906 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.193e-7■■■■■ 35.5
ILF3Q12906 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.641e-7■■■■■ 35.5
ILF3Q12906 PDS5B-206ENST00000481616 684 ntTSL 33.79□□□□□ -1.81e-7■■■■■ 35.5
ILF3Q12906 PDS5B-203ENST00000450460 5246 ntTSL 1 (best)2.35□□□□□ -2.031e-7■■■■■ 35.5
ILF3Q12906 RASA2-207ENST00000515549 494 ntTSL 418.14■□□□□ 0.494e-7■■■■■ 35.5
ILF3Q12906 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.254e-7■■■■■ 35.5
ILF3Q12906 RASA2-201ENST00000286364 5614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 35.5
ILF3Q12906 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.578e-8■■■■■ 35.3
ILF3Q12906 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -08e-8■■■■■ 35.3
ILF3Q12906 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.259e-9■■■■■ 35.2
ILF3Q12906 SEPT9-219ENST00000588575 559 ntTSL 420.3■□□□□ 0.849e-7■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 SEPT9-229ENST00000590576 583 ntTSL 320.27■□□□□ 0.849e-7■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 SEPT9-222ENST00000589070 582 ntTSL 318.42■□□□□ 0.549e-7■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 SEPT9-241ENST00000591934 553 ntTSL 417.19■□□□□ 0.349e-7■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 SEPT9-231ENST00000590595 569 ntTSL 316.02■□□□□ 0.169e-7■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.078e-7■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 SEPT9-217ENST00000587237 548 ntTSL 514.32□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 SEPT9-240ENST00000591833 576 ntTSL 414.25□□□□□ -0.139e-7■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.149e-7■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.289e-7■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 SEPT9-242ENST00000592098 503 ntTSL 413.26□□□□□ -0.299e-7■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.498e-7■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.518e-7■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.569e-7■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.578e-7■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 UBAP1-205ENST00000626262 1753 ntTSL 219.51■□□□□ 0.711e-8■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.661e-8■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.293e-9■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.383e-9■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.33e-9■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 TGFBR3-209ENST00000532540 3913 ntTSL 1 (best)6.45□□□□□ -1.383e-9■■■■■ 34.9
ILF3Q12906 FDFT1-203ENST00000446331 1558 ntTSL 222.81■■□□□ 1.242e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.842e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.752e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.732e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 FDFT1-207ENST00000525607 1773 ntTSL 218.51■□□□□ 0.552e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.422e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.022e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.062e-10■■■■■ 34.8
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ILF3Q12906 FDFT1-215ENST00000529464 932 ntTSL 1 (best)14.22□□□□□ -0.132e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.162e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.232e-10■■■■■ 34.8
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ILF3Q12906 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.262e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 FDFT1-204ENST00000525283 898 ntTSL 312.68□□□□□ -0.382e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 ATP6V0A1-209ENST00000586201 881 ntTSL 312.33□□□□□ -0.442e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.442e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 ATP6V0A1-217ENST00000588138 573 ntTSL 511.57□□□□□ -0.562e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 FDFT1-225ENST00000622850 1987 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.72e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 ATP6V0A1-205ENST00000544137 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.762e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 DHX9-201ENST00000367549 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.932e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 ATP6V0A1-202ENST00000343619 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.942e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 ATP6V0A1-201ENST00000264649 4110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.992e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 FDFT1-221ENST00000532266 583 ntTSL 58.36□□□□□ -1.072e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 FDFT1-212ENST00000528643 1909 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.142e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 ATP6V0A1-213ENST00000587510 564 ntTSL 47.13□□□□□ -1.272e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.332e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.342e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 FDFT1-213ENST00000528729 570 ntTSL 36.1□□□□□ -1.432e-10■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 YAP1-205ENST00000526594 785 ntTSL 34.69□□□□□ -1.661e-7■■■■■ 34.8
ILF3Q12906 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.287e-7■■■■■ 34.6
ILF3Q12906 ANPEP-209ENST00000560137 638 ntTSL 315.18■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 34.6
ILF3Q12906 ANPEP-205ENST00000559874 663 ntTSL 38.59□□□□□ -1.032e-8■■■■■ 34.6
ILF3Q12906 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 34.5
ILF3Q12906 PPP2R5C-227ENST00000557268 2013 ntTSL 213.61□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 34.5
ILF3Q12906 PPP2R5C-209ENST00000553890 492 ntTSL 311.37□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 34.5
ILF3Q12906 PPP2R5C-212ENST00000554442 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.783e-7■■■■■ 34.5
ILF3Q12906 PPP2R5C-201ENST00000328724 4045 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.973e-7■■■■■ 34.5
ILF3Q12906 PPP2R5C-215ENST00000556068 3363 ntTSL 26.27□□□□□ -1.413e-7■■■■■ 34.5
ILF3Q12906 PPP2R5C-213ENST00000554504 448 ntTSL 35.44□□□□□ -1.543e-7■■■■■ 34.5
ILF3Q12906 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.036e-7■■■■■ 34.4
ILF3Q12906 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 34.4
ILF3Q12906 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.596e-7■■■■■ 34.4
ILF3Q12906 INO80-205ENST00000558357 5503 ntTSL 1 (best)11.16□□□□□ -0.626e-7■■■■■ 34.4
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