Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC173Q0VFZ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC173Q0VFZ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC173Q0VFZ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC173Q0VFZ6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC173Q0VFZ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC173Q0VFZ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC173Q0VFZ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC173Q0VFZ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC173Q0VFZ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC173Q0VFZ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC173Q0VFZ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC173Q0VFZ6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC173Q0VFZ6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC173Q0VFZ6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC173Q0VFZ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC173Q0VFZ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC173Q0VFZ6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC173Q0VFZ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC173Q0VFZ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC173Q0VFZ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC173Q0VFZ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC173Q0VFZ6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC173Q0VFZ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC173Q0VFZ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC173Q0VFZ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC173Q0VFZ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC173Q0VFZ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC173Q0VFZ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC173Q0VFZ6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC173Q0VFZ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC173Q0VFZ6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC173Q0VFZ6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC173Q0VFZ6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC173Q0VFZ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC173Q0VFZ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC173Q0VFZ6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC173Q0VFZ6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC173Q0VFZ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC173Q0VFZ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC173Q0VFZ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC173Q0VFZ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC173Q0VFZ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC173Q0VFZ6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC173Q0VFZ6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC173Q0VFZ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC173Q0VFZ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC173Q0VFZ6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC173Q0VFZ6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC173Q0VFZ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC173Q0VFZ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC173Q0VFZ6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC173Q0VFZ6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC173Q0VFZ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC173Q0VFZ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms