Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EP300Q09472 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP300Q09472 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP300Q09472 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP300Q09472 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP300Q09472 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP300Q09472 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP300Q09472 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP300Q09472 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP300Q09472 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP300Q09472 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP300Q09472 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP300Q09472 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP300Q09472 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP300Q09472 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EP300Q09472 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EP300Q09472 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EP300Q09472 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EP300Q09472 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EP300Q09472 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EP300Q09472 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EP300Q09472 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EP300Q09472 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EP300Q09472 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EP300Q09472 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EP300Q09472 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EP300Q09472 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EP300Q09472 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EP300Q09472 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EP300Q09472 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EP300Q09472 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EP300Q09472 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EP300Q09472 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EP300Q09472 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP300Q09472 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP300Q09472 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP300Q09472 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP300Q09472 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EP300Q09472 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EP300Q09472 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP300Q09472 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EP300Q09472 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EP300Q09472 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EP300Q09472 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
EP300Q09472 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EP300Q09472 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EP300Q09472 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EP300Q09472 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EP300Q09472 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EP300Q09472 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EP300Q09472 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EP300Q09472 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EP300Q09472 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EP300Q09472 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EP300Q09472 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EP300Q09472 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EP300Q09472 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EP300Q09472 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EP300Q09472 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EP300Q09472 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EP300Q09472 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EP300Q09472 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EP300Q09472 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EP300Q09472 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EP300Q09472 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EP300Q09472 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP300Q09472 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP300Q09472 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EP300Q09472 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EP300Q09472 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EP300Q09472 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EP300Q09472 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EP300Q09472 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EP300Q09472 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EP300Q09472 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EP300Q09472 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EP300Q09472 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP300Q09472 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EP300Q09472 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EP300Q09472 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EP300Q09472 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EP300Q09472 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EP300Q09472 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EP300Q09472 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EP300Q09472 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EP300Q09472 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EP300Q09472 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EP300Q09472 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EP300Q09472 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
EP300Q09472 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP300Q09472 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP300Q09472 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP300Q09472 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP300Q09472 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP300Q09472 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EP300Q09472 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP300Q09472 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EP300Q09472 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EP300Q09472 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EP300Q09472 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms