Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
ABCC8Q09428 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
ABCC8Q09428 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.9■■■■■ 4.94
ABCC8Q09428 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
ABCC8Q09428 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
ABCC8Q09428 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
ABCC8Q09428 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
ABCC8Q09428 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCC8Q09428 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCC8Q09428 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCC8Q09428 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCC8Q09428 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCC8Q09428 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCC8Q09428 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCC8Q09428 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCC8Q09428 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCC8Q09428 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCC8Q09428 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
ABCC8Q09428 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.85■■■■■ 4.93
ABCC8Q09428 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC45.85■■■■■ 4.93
ABCC8Q09428 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
ABCC8Q09428 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
ABCC8Q09428 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC45.82■■■■■ 4.93
ABCC8Q09428 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC45.81■■■■■ 4.92
ABCC8Q09428 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC45.81■■■■■ 4.92
ABCC8Q09428 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
ABCC8Q09428 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
ABCC8Q09428 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
ABCC8Q09428 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
ABCC8Q09428 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
ABCC8Q09428 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.91
ABCC8Q09428 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
ABCC8Q09428 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC45.74■■■■■ 4.91
ABCC8Q09428 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
ABCC8Q09428 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
ABCC8Q09428 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
ABCC8Q09428 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
ABCC8Q09428 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC45.71■■■■■ 4.91
ABCC8Q09428 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC45.69■■■■■ 4.91
ABCC8Q09428 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC45.69■■■■■ 4.9
ABCC8Q09428 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
ABCC8Q09428 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
ABCC8Q09428 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
ABCC8Q09428 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC45.63■■■■■ 4.9
ABCC8Q09428 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
ABCC8Q09428 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
ABCC8Q09428 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.61■■■■■ 4.89
ABCC8Q09428 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
ABCC8Q09428 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC45.59■■■■■ 4.89
ABCC8Q09428 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
ABCC8Q09428 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
ABCC8Q09428 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCC8Q09428 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCC8Q09428 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCC8Q09428 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCC8Q09428 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCC8Q09428 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCC8Q09428 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCC8Q09428 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
ABCC8Q09428 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.54■■■■■ 4.88
ABCC8Q09428 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
ABCC8Q09428 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
ABCC8Q09428 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC45.52■■■■■ 4.88
ABCC8Q09428 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
ABCC8Q09428 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC45.5■■■■■ 4.87
ABCC8Q09428 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
ABCC8Q09428 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
ABCC8Q09428 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
ABCC8Q09428 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
ABCC8Q09428 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
ABCC8Q09428 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC45.47■■■■■ 4.87
ABCC8Q09428 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.47■■■■■ 4.87
ABCC8Q09428 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
ABCC8Q09428 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
ABCC8Q09428 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
ABCC8Q09428 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
ABCC8Q09428 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.87
ABCC8Q09428 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
ABCC8Q09428 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC45.4■■■■■ 4.86
ABCC8Q09428 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
ABCC8Q09428 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC45.4■■■■■ 4.86
ABCC8Q09428 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
ABCC8Q09428 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
ABCC8Q09428 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
ABCC8Q09428 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC45.37■■■■■ 4.85
ABCC8Q09428 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
ABCC8Q09428 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
ABCC8Q09428 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
ABCC8Q09428 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC45.35■■■■■ 4.85
ABCC8Q09428 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
ABCC8Q09428 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
ABCC8Q09428 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
ABCC8Q09428 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
ABCC8Q09428 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
ABCC8Q09428 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
ABCC8Q09428 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
ABCC8Q09428 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
ABCC8Q09428 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
ABCC8Q09428 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
ABCC8Q09428 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms