Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLEQ07864 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLEQ07864 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLEQ07864 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLEQ07864 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLEQ07864 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLEQ07864 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLEQ07864 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLEQ07864 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLEQ07864 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLEQ07864 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POLEQ07864 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLEQ07864 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLEQ07864 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLEQ07864 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLEQ07864 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLEQ07864 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLEQ07864 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLEQ07864 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLEQ07864 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLEQ07864 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLEQ07864 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLEQ07864 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLEQ07864 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLEQ07864 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLEQ07864 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLEQ07864 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLEQ07864 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLEQ07864 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLEQ07864 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLEQ07864 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLEQ07864 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLEQ07864 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLEQ07864 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLEQ07864 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POLEQ07864 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLEQ07864 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLEQ07864 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLEQ07864 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLEQ07864 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLEQ07864 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLEQ07864 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLEQ07864 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLEQ07864 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLEQ07864 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLEQ07864 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLEQ07864 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLEQ07864 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLEQ07864 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLEQ07864 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLEQ07864 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLEQ07864 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLEQ07864 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLEQ07864 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLEQ07864 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLEQ07864 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLEQ07864 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLEQ07864 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLEQ07864 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLEQ07864 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLEQ07864 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLEQ07864 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLEQ07864 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLEQ07864 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLEQ07864 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLEQ07864 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLEQ07864 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLEQ07864 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLEQ07864 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLEQ07864 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLEQ07864 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLEQ07864 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLEQ07864 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLEQ07864 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLEQ07864 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLEQ07864 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLEQ07864 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLEQ07864 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLEQ07864 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLEQ07864 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLEQ07864 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLEQ07864 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLEQ07864 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLEQ07864 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLEQ07864 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLEQ07864 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLEQ07864 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLEQ07864 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
POLEQ07864 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLEQ07864 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLEQ07864 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLEQ07864 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLEQ07864 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLEQ07864 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLEQ07864 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLEQ07864 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLEQ07864 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLEQ07864 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLEQ07864 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLEQ07864 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms