Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UBXN1Q04323 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
UBXN1Q04323 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBXN1Q04323 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
UBXN1Q04323 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBXN1Q04323 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
UBXN1Q04323 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBXN1Q04323 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBXN1Q04323 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBXN1Q04323 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBXN1Q04323 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBXN1Q04323 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBXN1Q04323 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBXN1Q04323 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBXN1Q04323 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBXN1Q04323 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBXN1Q04323 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBXN1Q04323 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBXN1Q04323 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBXN1Q04323 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
UBXN1Q04323 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
UBXN1Q04323 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
UBXN1Q04323 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBXN1Q04323 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UBXN1Q04323 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBXN1Q04323 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBXN1Q04323 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBXN1Q04323 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBXN1Q04323 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBXN1Q04323 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UBXN1Q04323 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBXN1Q04323 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBXN1Q04323 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBXN1Q04323 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBXN1Q04323 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBXN1Q04323 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBXN1Q04323 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBXN1Q04323 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN1Q04323 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN1Q04323 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN1Q04323 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN1Q04323 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN1Q04323 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN1Q04323 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN1Q04323 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms