Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NHLH2Q02577 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NHLH2Q02577 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHLH2Q02577 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLH2Q02577 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLH2Q02577 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLH2Q02577 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NHLH2Q02577 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLH2Q02577 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLH2Q02577 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLH2Q02577 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHLH2Q02577 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHLH2Q02577 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHLH2Q02577 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLH2Q02577 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLH2Q02577 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLH2Q02577 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHLH2Q02577 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NHLH2Q02577 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLH2Q02577 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLH2Q02577 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLH2Q02577 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLH2Q02577 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NHLH2Q02577 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHLH2Q02577 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHLH2Q02577 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLH2Q02577 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLH2Q02577 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLH2Q02577 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLH2Q02577 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLH2Q02577 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLH2Q02577 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLH2Q02577 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NHLH2Q02577 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NHLH2Q02577 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms