Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPNP63162 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPNP63162 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPNP63162 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPNP63162 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPNP63162 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPNP63162 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPNP63162 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPNP63162 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPNP63162 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPNP63162 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRPNP63162 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPNP63162 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPNP63162 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPNP63162 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPNP63162 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPNP63162 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRPNP63162 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRPNP63162 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPNP63162 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPNP63162 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPNP63162 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPNP63162 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNRPNP63162 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPNP63162 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPNP63162 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms