Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VSNL1P62760 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VSNL1P62760 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VSNL1P62760 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VSNL1P62760 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VSNL1P62760 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VSNL1P62760 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VSNL1P62760 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VSNL1P62760 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VSNL1P62760 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VSNL1P62760 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VSNL1P62760 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VSNL1P62760 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VSNL1P62760 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VSNL1P62760 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VSNL1P62760 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSNL1P62760 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSNL1P62760 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VSNL1P62760 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VSNL1P62760 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VSNL1P62760 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VSNL1P62760 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VSNL1P62760 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VSNL1P62760 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VSNL1P62760 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSNL1P62760 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSNL1P62760 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSNL1P62760 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSNL1P62760 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VSNL1P62760 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSNL1P62760 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VSNL1P62760 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSNL1P62760 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSNL1P62760 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VSNL1P62760 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VSNL1P62760 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSNL1P62760 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSNL1P62760 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSNL1P62760 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VSNL1P62760 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VSNL1P62760 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSNL1P62760 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VSNL1P62760 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSNL1P62760 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VSNL1P62760 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSNL1P62760 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VSNL1P62760 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSNL1P62760 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VSNL1P62760 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSNL1P62760 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSNL1P62760 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VSNL1P62760 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSNL1P62760 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VSNL1P62760 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VSNL1P62760 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSNL1P62760 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VSNL1P62760 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSNL1P62760 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSNL1P62760 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VSNL1P62760 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSNL1P62760 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VSNL1P62760 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSNL1P62760 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSNL1P62760 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VSNL1P62760 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
VSNL1P62760 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VSNL1P62760 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VSNL1P62760 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms