Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSMA6P60900 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PSMA6P60900 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA6P60900 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PSMA6P60900 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA6P60900 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PSMA6P60900 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA6P60900 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA6P60900 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA6P60900 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA6P60900 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA6P60900 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PSMA6P60900 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA6P60900 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PSMA6P60900 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMA6P60900 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PSMA6P60900 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PSMA6P60900 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMA6P60900 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMA6P60900 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms