Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPS1P60891 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPS1P60891 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPS1P60891 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPS1P60891 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPS1P60891 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPS1P60891 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPS1P60891 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPS1P60891 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPS1P60891 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPS1P60891 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPS1P60891 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPS1P60891 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPS1P60891 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPS1P60891 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPS1P60891 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPS1P60891 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPS1P60891 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPS1P60891 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPS1P60891 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPS1P60891 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPS1P60891 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPS1P60891 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPS1P60891 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPS1P60891 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPS1P60891 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPS1P60891 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPS1P60891 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPS1P60891 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPS1P60891 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPS1P60891 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPS1P60891 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPS1P60891 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPS1P60891 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPS1P60891 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPS1P60891 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPS1P60891 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPS1P60891 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPS1P60891 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPS1P60891 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPS1P60891 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPS1P60891 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms