Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRG3P56975 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRG3P56975 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRG3P56975 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRG3P56975 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRG3P56975 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRG3P56975 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRG3P56975 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRG3P56975 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRG3P56975 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRG3P56975 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRG3P56975 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRG3P56975 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRG3P56975 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRG3P56975 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRG3P56975 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRG3P56975 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRG3P56975 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRG3P56975 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRG3P56975 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRG3P56975 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NRG3P56975 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRG3P56975 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRG3P56975 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NRG3P56975 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRG3P56975 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRG3P56975 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NRG3P56975 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRG3P56975 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NRG3P56975 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRG3P56975 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NRG3P56975 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRG3P56975 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRG3P56975 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRG3P56975 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRG3P56975 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRG3P56975 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRG3P56975 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRG3P56975 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRG3P56975 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRG3P56975 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRG3P56975 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRG3P56975 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRG3P56975 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRG3P56975 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRG3P56975 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRG3P56975 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRG3P56975 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRG3P56975 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRG3P56975 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRG3P56975 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRG3P56975 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRG3P56975 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRG3P56975 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRG3P56975 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRG3P56975 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRG3P56975 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRG3P56975 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRG3P56975 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRG3P56975 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRG3P56975 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRG3P56975 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRG3P56975 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRG3P56975 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRG3P56975 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRG3P56975 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRG3P56975 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRG3P56975 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRG3P56975 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRG3P56975 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRG3P56975 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NRG3P56975 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NRG3P56975 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NRG3P56975 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRG3P56975 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NRG3P56975 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NRG3P56975 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRG3P56975 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NRG3P56975 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRG3P56975 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRG3P56975 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRG3P56975 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NRG3P56975 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRG3P56975 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRG3P56975 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRG3P56975 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NRG3P56975 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NRG3P56975 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRG3P56975 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRG3P56975 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRG3P56975 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRG3P56975 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NRG3P56975 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRG3P56975 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NRG3P56975 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NRG3P56975 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRG3P56975 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRG3P56975 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NRG3P56975 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRG3P56975 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms