Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCKAP1LP55160 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NCKAP1LP55160 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCKAP1LP55160 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCKAP1LP55160 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCKAP1LP55160 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NCKAP1LP55160 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NCKAP1LP55160 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCKAP1LP55160 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCKAP1LP55160 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCKAP1LP55160 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCKAP1LP55160 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCKAP1LP55160 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCKAP1LP55160 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCKAP1LP55160 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCKAP1LP55160 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCKAP1LP55160 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCKAP1LP55160 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCKAP1LP55160 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCKAP1LP55160 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCKAP1LP55160 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCKAP1LP55160 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCKAP1LP55160 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCKAP1LP55160 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCKAP1LP55160 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCKAP1LP55160 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCKAP1LP55160 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCKAP1LP55160 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCKAP1LP55160 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCKAP1LP55160 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCKAP1LP55160 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCKAP1LP55160 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NCKAP1LP55160 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCKAP1LP55160 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCKAP1LP55160 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCKAP1LP55160 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCKAP1LP55160 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCKAP1LP55160 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCKAP1LP55160 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCKAP1LP55160 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCKAP1LP55160 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCKAP1LP55160 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCKAP1LP55160 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCKAP1LP55160 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCKAP1LP55160 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NCKAP1LP55160 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCKAP1LP55160 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCKAP1LP55160 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCKAP1LP55160 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCKAP1LP55160 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCKAP1LP55160 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCKAP1LP55160 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCKAP1LP55160 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCKAP1LP55160 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCKAP1LP55160 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCKAP1LP55160 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCKAP1LP55160 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NCKAP1LP55160 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCKAP1LP55160 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NCKAP1LP55160 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCKAP1LP55160 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCKAP1LP55160 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCKAP1LP55160 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCKAP1LP55160 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCKAP1LP55160 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCKAP1LP55160 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1067 ms