Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCNN1BP51168 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCNN1BP51168 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCNN1BP51168 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCNN1BP51168 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCNN1BP51168 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCNN1BP51168 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCNN1BP51168 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCNN1BP51168 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCNN1BP51168 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SCNN1BP51168 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCNN1BP51168 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCNN1BP51168 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCNN1BP51168 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SCNN1BP51168 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCNN1BP51168 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCNN1BP51168 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCNN1BP51168 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCNN1BP51168 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SCNN1BP51168 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCNN1BP51168 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCNN1BP51168 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCNN1BP51168 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCNN1BP51168 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCNN1BP51168 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCNN1BP51168 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCNN1BP51168 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCNN1BP51168 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCNN1BP51168 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCNN1BP51168 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCNN1BP51168 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCNN1BP51168 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCNN1BP51168 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCNN1BP51168 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCNN1BP51168 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCNN1BP51168 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCNN1BP51168 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCNN1BP51168 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCNN1BP51168 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCNN1BP51168 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCNN1BP51168 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCNN1BP51168 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCNN1BP51168 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCNN1BP51168 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCNN1BP51168 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCNN1BP51168 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCNN1BP51168 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCNN1BP51168 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCNN1BP51168 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCNN1BP51168 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCNN1BP51168 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCNN1BP51168 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCNN1BP51168 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCNN1BP51168 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCNN1BP51168 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCNN1BP51168 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCNN1BP51168 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCNN1BP51168 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCNN1BP51168 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCNN1BP51168 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCNN1BP51168 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCNN1BP51168 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCNN1BP51168 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCNN1BP51168 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCNN1BP51168 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCNN1BP51168 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCNN1BP51168 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCNN1BP51168 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCNN1BP51168 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCNN1BP51168 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCNN1BP51168 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCNN1BP51168 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SCNN1BP51168 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCNN1BP51168 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCNN1BP51168 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCNN1BP51168 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCNN1BP51168 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms