Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TSC2P49815 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSC2P49815 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TSC2P49815 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TSC2P49815 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSC2P49815 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TSC2P49815 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TSC2P49815 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TSC2P49815 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSC2P49815 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TSC2P49815 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TSC2P49815 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TSC2P49815 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSC2P49815 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSC2P49815 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSC2P49815 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TSC2P49815 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSC2P49815 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSC2P49815 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TSC2P49815 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSC2P49815 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSC2P49815 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TSC2P49815 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TSC2P49815 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSC2P49815 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSC2P49815 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSC2P49815 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSC2P49815 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSC2P49815 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSC2P49815 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSC2P49815 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSC2P49815 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSC2P49815 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSC2P49815 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSC2P49815 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSC2P49815 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSC2P49815 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSC2P49815 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSC2P49815 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSC2P49815 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TSC2P49815 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSC2P49815 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TSC2P49815 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TSC2P49815 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TSC2P49815 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TSC2P49815 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSC2P49815 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSC2P49815 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSC2P49815 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSC2P49815 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSC2P49815 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSC2P49815 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSC2P49815 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSC2P49815 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TSC2P49815 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSC2P49815 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSC2P49815 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSC2P49815 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSC2P49815 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSC2P49815 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSC2P49815 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TSC2P49815 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TSC2P49815 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TSC2P49815 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSC2P49815 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSC2P49815 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TSC2P49815 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TSC2P49815 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSC2P49815 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSC2P49815 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSC2P49815 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSC2P49815 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TSC2P49815 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSC2P49815 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TSC2P49815 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSC2P49815 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TSC2P49815 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TSC2P49815 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TSC2P49815 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TSC2P49815 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TSC2P49815 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSC2P49815 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSC2P49815 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSC2P49815 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSC2P49815 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSC2P49815 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TSC2P49815 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TSC2P49815 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TSC2P49815 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSC2P49815 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSC2P49815 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TSC2P49815 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TSC2P49815 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSC2P49815 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSC2P49815 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSC2P49815 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TSC2P49815 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TSC2P49815 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TSC2P49815 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TSC2P49815 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms