Protein–RNA interactions for Protein: P49767

VEGFC, Vascular endothelial growth factor C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFCP49767 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VEGFCP49767 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VEGFCP49767 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VEGFCP49767 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VEGFCP49767 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VEGFCP49767 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms